У меня похожая ситуация. Создал доп. домен (slaedthemes.com с "slaedthemes" в качестве логина, основной домен - decodos.net). По ссылке http://slaedthemes.decodos.net все работает, а по http://slaedthemes.com - нет.
P.S. Это мой третий доп.домен из 7, предыдущие два отлично работают.